ღია წაკითხვის ჩარჩო
ღია წაკითხვის ჩარჩო (ინგლ. Open Reading Frame, ORF) — დნმ-ის ან რნმ-ის შემადგენლობაში ნუკლეოტიდების თანმიმდევრობა, რომელსაც პოტენციურად შეუძლია ცილების კოდირება. ORF-ის არსებობს მთავარი პარამეტრი არის თანმიმდევრობის საკმარისად გრძელ უბანზე სტარტ-კოდონის შემდეგ (უმეტესწილად — AUG
) სტოპ-კოდონების არარსებობა, ხშირ შემთხვევაში (რნმ-ისთვის) — UAA
, UGA
და UAG
. იქინდა გამომდინარე, რომ ზოგიერთ შემთხვევაში სტარტ- და სტოპ-კოდონები განსხვავდება კანონიკურებისგან, აგრეთვე იმის გათვალისწინებით, რომ ტრანსლაციისას ზოგიერთი ორგანიზმში შესაძლებელია სტოპ-კოდონების სუპრესია (მოქმედების დათრგუნვა), ღია წაკითხვის ჩარჩოს განსაზღვრისას იყენებენ ალგორითმებს, რომლებიც ითვალისწინებენ ამ განსხვავებებს.
იხილეთ აგრეთვე
რედაქტირებარესურსები ინტერნეტში
რედაქტირება- ORF Investigator ORF finding and Gene alignment program developed by Vivek Dhar Dwivedi and Sarad Kumar Mishra.
- Translation and Open Reading Frames